农村宅基地纠纷

本人把自家猪圈和原烟棚用地改建为现厨房和侧所，改建后邻居说我家占了他家的宅基使用地，当时农村土地测量是烟棚不能量入我家宅基地，量在了邻居家的使用证上，现在造成占地的原因是：   我家证上圈的位置和绘在邻居家图上的我家烟棚位置是同一块地。
但在争议时村委和当地政府均认为我家占地，他们的理由是：1、以本为证。2、我家撤掉了争议证据。
   我不明白的问题是：1、以本为证，双方证均有法律保证，但双方本出现与事实相背（圈与烟棚为同一块地）矛盾时，为何不保证我家利益，说我家证无效。2、我家在原来的猪圈和原烟棚上修建厨房和侧所，撤掉木圈，为何叫撤毁证据。3、听说法院可以解决，我也去了咨询了，但说我家无起诉依据，邻居家总是来吵，我怕出事，现村委政府又维护邻居家，听说他家市里有人。
   我是福泉市凤山镇的，渴望得到律师的帮助，期望回复！谢谢！