村尾企业办与企业间的合同纠纷

【咨询】请问我们现在工厂要搬迁,因为村尾告知我们今年九月合同到期将不续租,厂房要拆掉改建,现在我们已经找到新厂房了,现在村尾却说我们违约,还说厂房并没有要拆掉改建,不让搬设备,原因是因为我们把当初我们自己花钱装修的一些东西拆掉拿去当废品处理掉了,村尾找了本地治安队将我们厂里的大门给锁住,也不准人进出,24小时派人看管,还到处放风声说我们工厂欠了几个月厂租水电没缴,恶意中伤我们,我们都知道签定租赁合同的时候一般都是签了两份,一份要向房产管理部门备案用的,这份合同内容基本是双方权利平等的,另外要签一份私底下的合同,这份基本上对我们厂方基本上是完全没有保障的,比如违约除了押金不退还,还要赔偿村尾两个月的租金,以及厂内只能搬走一些机器设备,其他东西不准更动(其实就是他们事后想自己把一些电线或是架子角铁什么的拿去变卖捞点钱),透过旁人给的建议是让我们向村尾的企业办经理包红包,请问这情况该如何处理？如果打官司上诉私底下签的这份没备案的合同能算是有效的合同吗？