劳动合同纠纷

本人2003年九月进单位，经过3个月实习期后签订所谓临时工合同，2008年1月因劳动法出台签订正式合同，2013年3月单位裁员。单位给予的经济赔偿是2008年-2013年，每年按照一个月工资金额赔偿了6年的，2003年-2007年的不算工龄，称没合同。2004年-2007年按单位要求自己缴纳了养老保险，2008年签合同后单位缴纳了三金。现与单位协商，1，2004-2007年的经济补偿。2，2004-2007的三金。单位给予回复，1，2008年签合同之前先签订了一份辞职协议，所以不给了。2，2003年实习期过后签的合同里有一条是工资里含三金的，所以不补。
我申请了仲裁，碑林区仲裁委员会收了我的申请书，但说十有八九会给出不予受理，因为我要求的都是2007年之前的，超过时限了，他们管不了，让我去法院告，我有点接受不了这种说法，我该怎么办？