买的房产有两个证？现在在一方买房，以哪份为准？过户不了。

在樟木头买了一栋私宅，是本地人的，我们已经付钱了，还有一点点尾款没付。现在我们过户时却过不了。国土局说房产重证了，说有两个房产证。第一个是一个房地产开发的房产，第二个就是我买房的房主（房子是管理器卖出去的不知道什么原因，第一个房主一直没有管理这一部分的地产，后来管理区又卖给了本地村民。国土局也发了两个证出去，国土局的回应我们是：以前制度不完善，没有电脑，才造成这样的漏洞，那到底以哪份房产证为准？）。
   现在我们已经付款了，房子也装修了，现在才说过户不了，怎么办？如果去公证的话，房子我们能受到法律的保护吗？
   如果是说退钱的话可以吗？房子都是我和房主的老公经手的，写的收据都是她老公写的，如果退钱的话，装修费能一起退回吗？