滥用职权导致企业巨额损失

这个是最近我家邻居甲的真实案例：
    甲是某未上市个人企业财务总监，运用其职务之便（手里有企业所有章），在企业老板未知情的情况下以企业名义向某银行最为担保人贷款2000万给乙公司，乙公司是甲所在企业的长期合作伙伴，此前甲企业作为担保也向银行贷款了3000万给乙公司，但是那3000万老板是知情的。甲从乙公司牟取了私人利益。现在乙公司老板拿了钱跑了，不知去向。 甲所在企业面临5000万的担保责任。 
    我想咨询的是甲所在企业应当负责3000万的责任还是5000万的责任？甲应当受到怎么样的处罚，是否应当负刑事责任？另外，甲如果应当承担赔偿责任，其在事发前为其20岁的儿子购有一套200万的房子，此房子为其儿子名下，此房是否应当被法院查封？