全额集资商铺继承过户需要补契税吗？过户后能不能直接去土地局办理土地证？

我妈妈在世时在2003年向工商银行购买了两间商铺（未交纳契税）据说这块土地是工行的划拨土地，两个房产证于2006年拿到手（土地证钱交给了工商银行却一直没有拿到手）现在妈妈去世了，我继承了该门面的2分之1产权，另外2分之1我父亲办理了赠与公证赠送给我，现在这两间门面属于我的，在公证完和交完契税，印花税后我到房产局办理过户手续，房产局不给我办理，说两个房产证上写的用途是商用，产权来源是全额集资，说商铺只能是商用，产权来源不能是全额集资形式，必须叫我补清这两间门面的契税后还要工商银行出具相关证明才给我办理过户手续，请问1：全额集资的门面房是不是像房产局所说的要我补清妈妈未交纳的契税后才能给我办理过户手续；2：如果我补请了契税办理了商用的房产证后，是不是可以直接去土地局办理土地证呀？