怎么才可以给孩子上户口

请问下，当时因为我年龄未够结婚了。现在因为感情不好，闹离婚了。我们已经有了一个2岁的女女，一个1岁的仔仔。现在离婚，我们协议好了。这样对女方也好，她以后也容易找对象。孩子让我《男方》带。但是现在的问题是，我该如何给孩子上户口。去问当地派出所，他们说孩子户口要入在女方那里。我不懂，为什么男方有权力带孩子，就没权力给孩子进户口。难道不是我的么。有出生证明的。请问我该怎么办。才可以给孩子进户口，因为以后孩子要读书，我们大人的事，与孩子无关，孩子无辜的，不能给孩子进户口，以后怎么读书。请问我该如何办。