计生局宣布12年前所领的准生证作废对吗？

我一亲戚一直是农村户口，1994年以自然劳动力增长的形式在农场就业（内部就业，没通过劳动局批准），1999年离开单位（但没终止内部用工），将户口迁到夫家农村落户，村里分了责任田和山，因没耕种能力就将田和山交给兄弟耕种，也由兄弟缴费，但是没明确到她和女儿个人身份。2000年，她领到第二胎生育证生了个男孩。2001年政策规定科级干部科照顾配偶农转非，她就出了500元办了农转非手续，而后从原单位农场也办了调动手续调动到另一单位,由个人交足了养老保险后劳动局承认了工龄。2013年有人上访讲她是非法生育，市计生局调查后认定是合法的。2014年市计生局又讲是不合法的，县计生局依此下文认定所发二胎生育证作废。下文讲一是农场从没终止过用工合同以致后来调到新单位,还认了连续工龄，二是电脑查不到当时迁入农村的记录（当时应该没联网的），三是认为她那本农村户口来历不明，以此县计生局作出十多年前所发准生证作废的决定。
请指导，计生局决定是否合法，合法或不合法处在哪？
谢谢！