关于公司合法性的问题

在2005年，公司的董事长秘密召集了当时的6位骨干说是要成立一个小公司，目的是为了奖励这6个人，想让大家多挣点钱，成立的小公司要这6个人每人出资10万元入股，每人占有公司1.5%的股份，然后每年可以有三万元的分红。由于当时大家都不懂法，一切又都是在秘密的情况下进行的，所以导致现在想要辞职但是就股份一事却协商不好了。有以下几个问题请教律师：
一、公司成立时我们没有见到过公司章程，公司董事长我们的大股东也从没有跟我们提过这件事，他大股东这样的做法是否违反了公司法？
二、我们小股东出资十万，但是没有人给我们出资证明书，这个出资证明书应该由谁给我们开具，工商部门是否应该备案？
三、我们从未召开过股东大会，就连董事长换过了我们都不知道，我们占有的股份少是否就没有股东知情权？
现在我们对公司的合法性表示怀疑，如果以上几条公司的大股东都违反了，那现在这个小公司的存在是否合法？我们以什么名义起诉他，以便我们争取自己的权益。谢谢！