农村房屋申请房契时，在告示贴出后遭邻居恶意反对导致镇上的国土所不予以办理房契，该如何处理？

我农村家的房子是正方形的，其中有四分之三是在1989年已经盖好了并在后来申请了房契，另外的四分之一在2004年时盖好，当时没有办理房契，2012年在办理房契的过程中，却因为房子后面紧挨着的一间小房子的主人到村委会那里去反对，说“我家的房子占多了一点地，那块地导致他和另外两家分到的和实际面积不对，（另外两家是有房契，他家没有房契的）三家的书面上的面积合起来比实际多了，现在就怀疑我家的占地多了。”从而导致镇上的国土所不予以办理房契。我家后来盖的那四分之一的房子是按照原来房子的墙边扩建的，根本不存在占地多了的说法，而且那块地得三家人本身在很久以前就有过争议，也是认为发放不合理，当时村委会的大队长就已经提出解决方案把问题解决了，但是现在那些人又出来反对，导致拖了很长的时间还是没有得到解决，那我应该按照什么程序去出来呢？