房产纠纷

本人在一二手房交易中遇到了麻烦。大概情况是：2004年购买一二手房，由于各种原因拖至现在办理房产证，但已实质居住了6年。当时购房协议上规定了卖房者需配合我们进行房屋过户。可卖主因为高涨的房价拒绝办理过户。我询问的问题是：如果将卖主告上法庭，购房款应该如何返还？是否可以按照当时房价和现在房价的对等价位进行赔偿？精装修能否折算为一部分赔偿？6年交纳的物业管理费等相关房屋使用费用如何清算？
另需说明的是：卖主和我原属于同一单位，且该房为三线调迁房改房。04年拿到我的购房款后卖主搬迁至外地，今天10月为房屋过户从外地赶回。在对比了房价之后，本已办理一半的房屋过户手续，在公证处电话确认时临时反悔。无法调解的情况下只能付诸法律。