在律所实习，辞职后产生纠纷怎么办？

大家好！我是一名刚毕业的法学专业毕业生，之前在一家律师事务所上班，辞职之后一个月，被原来的领导诬陷我偷了公司的卷宗档案。求大家帮帮我，我刚出社会什么都不懂，现在我把事情的经过简单描述： 

之前我负责公司的一个案件，有一天公司老总示意我打电话叫当事人来公司签风险协议，顺便把证据原件收过来，我向当事人收来以后向公司领导请示，他让我把证据原件放进卷宗袋里，然后把卷宗放在公司的抽屉，他需要的时候自己会去拿。我都一一照做了。8月19日发工资的时候无故扣我1000元工资，我和他吵一顿以后当场辞职，他同意我辞职，还口头对我说“你的工作能力不行，不需要交接”，我就说好。就这样第二天就开始没有去上班。9月11日（距离辞职已经过了21天）他给我打电话说那个卷宗袋找不到让我回去找，找不到的话就要去市局报案，而且要以“遗失案件原件”起诉告我，还给我发恐吓短信说是晚上要带人来我家找我“玩”，现在我应该怎么办？现在他说要告我，说是我把卷宗袋弄丢的！（证据原件是一张20万的欠条，和当事人收证据原件的时候没有签任何签收单，我和公司也未签订任何劳动合同，做的一切事情都是公司老总授意我做的。） 

现在我辞职了一个月，他才说东西丢了要我赔偿，要起诉我！说是当事人作为人证证明当时把证据原件交给我了（当事人和公司老总是同学关系）。现在他反过来诬赖我说案件卷宗和证据原件丢了让我负责！说是要到市公安局报案抓我。我想问下： 
1、他认识很多社会上的人，如果利用人脉关系让警察把我抓到公安局，我应该如何应对？ 
2、他现在能不能起诉我？他现在说是当事人做证亲手把证据原件交给我了。我自己也承认是收了证据原件（但是是公司老总叫我收的，收来以后他就叫我放在公司的抽屉，但是现在他不承认是他叫我收的，也不承认是他叫我放在公司抽屉）。 
3、他们起诉我的话，我打赢的几率大不大？赢的几率占百分之多少？类似的案子法院会怎么判？ 

我只是一个刚出社会参加工作的法学毕业生，一心想着学好法律这门功课出了社会能为老百姓服务，没想到居然遇到了这样的事，自己还惹上了官司，我现在心里很乱，找不到人帮助，在这里发帖子希望大家能给我出出主意，救救我这个刚毕业的学生，我家里是农村的没有钱