交通事故伤者可出院了，次要责任方未主动调解

各位资深长官
    你们好~ 
    我父亲2014年08月发生事故一个月，经过医院治疗；目前已达到暂时可以出院调养条件。
    截止目前为止，医疗费用已花近10万元；我方占主要责任方；对方占次要责任方；对方前期只预交医疗费用1万元；现已符合出院调养条件；对方车辆公司一直未出面调解；只有保险公司来过两次；第一次探望、第二次告知就等鉴定结果出来后；也不知道是几个意思；交警目前自从鉴定责任书9月17日出具后；至今未组织调解；我方现在处于被动情况。
    烦请各位资深长官指导
 1.我方现在自行办理出院，院方资料需要注意留意那些细节；以便日后司法程序可用。
 2.肩膀三处骨折、腿部小腿大小骨骨折；两处均位于右方；我想咨询下；现在我方如果自行办理出院；可以申请交通事故伤残鉴定嘛？ 
  是直接拿着CT资料还有其他病历说明?还是需要经过交警方面出具证明方可到指定机构进行鉴定？
 3.截止责任认定书出具一周以来；未组织调解；我方现在也打算最终进入司法程序了；请问我需要准备哪些有法律效益的文件呢？
需要进行哪些举证证明？