合同纠纷

此案是原告与被告人A与B之间的纠纷 ，被告A与B曾在2005年5月至2006年6月期间合伙借用上井加公司的平台与原告公司有业务往来，其中A是小股东B是大股东。2006年6月拆伙后被告A与被告B分别单独成立了公司与原告公司继续业务往来。 2013年10月原告与被告人A签订了一份货款的结算协议（见附件），被告原告称其与被告人B对账有一笔35万的款项没对上，票据上的签收人是被告A的，因此协议上还写了一条“被告人A于2006年4月签收原告的35万元款项，该款项是被告人A与B借用上井加平台进行个人合伙期间的款项，被告A与其存在争议，日后再议。”后面附上票据的号码与金额。支票收款人都是其他第四方。后来原告并未按协议付款，并于2014年6月，以这份协议起诉要求我们归还35万元借款，并以此案未结为由拒绝付款，至9月经过多次协商，他们坚持只付一部分货款，另17.5万元开了张没密码的支票要等案子终审才给用。详见附件。现在那个借款纠纷案没证据他们又改成买卖合同案了，然后被告B申请了管辖异议，至今还没转到本地。
问题1.   我们A方是否可以另外就此协议起诉此案原告违约，要求其支付17.5万元并且赔偿利息损失？
问题2.   附件中关于17.5万元的保证书，会不会对起诉有影响。问题3.   如果我们另外起诉，他们提起这35万元的案子问题，是否会合并审理。