经济纠纷案件原告撤诉，卷宗中为什么没有了当时的一份调解协议？

2012年2月29日下午我父亲许利吉的一个老战友仇光正来我父亲家玩，闲谈之中他就问我父亲“老许你的钱放到哪里了”我父亲就告诉他说“这些年我攒的那几个钱放到我女婿哪里了”仇光正说“我也有点钱能放到你女婿那里吗？”我父亲说“这个我得给你问问”随后我父亲给我妹夫杜圣林打了电话。
    杜圣林来到我父亲家之后和仇光正把一些借款事宜协商好，仇光正回家拿了8万元现金给了杜圣林，杜圣林写了张欠条给了仇光正拿着钱走了。杜圣林走了之后仇光正继续在许利吉家玩大约过了一小时左右仇光正说“老许我和你女婿不熟，要不我把这张条子下你给我写一张吧”当时我父亲说“行，老战友这忙是该帮的”之后我父亲就给仇光正写了张欠条把欠条给了仇光正，仇光正把杜圣林写的欠条留给了我父亲。
    后来杜圣林把煤厂运营的的钱搞了民间借贷，到了还款的时候杜圣林也没还我父亲钱，也没还仇光正钱。仇光正依手中的欠条起诉了许利吉，法庭调解了该案，许利吉当时没有委托律师自己写了应诉把情况以上的说明了一下，法官问仇光正是不是事实，仇光正也当庭承认事实是，后来法官让杜圣林出来作证，杜圣林也说是事实，之后杜圣林和仇光正达成了还款协议，仇光正撤诉。后来结果杜圣林没在协议日期还款，仇光正又起诉了许利吉，起诉理由是与我父亲达成了口头还款协议，并没履行还款义务，当时我父亲以还款协议是杜圣林和仇光正协议的，他们还在协议书上签了字，法庭留下了协议书为由向法庭进行了辩护，2015年3月3日法院判决书判决许利吉败诉。
    收到判决书后我们找了律师准备提起上诉，律师到法庭查阅该案的法庭调解资料，资料中只有许利吉和仇光正陈述的内容没有了杜圣林和仇光正达成的还款协议。
    我想咨询的是杜圣林和仇光正的还款协议应该在在案宗中保存吗？