劳动纠纷2015.3.19

您好，支律师： 本人2014年2月25日入职上海一家钢结构工程公司，职务为项目经理，与单位签订了一份3年的薪资仅为2500每月表面合同，公司以此交社会保险费。但此外跟公司实际还签订了一份“薪资确认单”，实际工资为10000元每月，2500元每月（一级建造师费用），项目补贴大约2200元每月，满一年后绩效工资14000元。但此份薪资确认单，员工签完字后即被公司收回。 在公司的一年时间内，公司多次出现拖欠发放工资的情况，所以本人于2015年1月14日提出书面辞职报告，但公司迟迟推迟不审批，这几天本人说要劳动仲裁时，才办理退工单（2014年3月14日），但结算时存在较大分歧。 虽然公司不出具“薪资确认单”，但每个月的银行流水可查，同时公司在打卡的时候，采取了一定得规避办法，只有2500元为工资，其他都是柜台存款形式。目前公司还有2015年1，2,3月工资未发，项目部补贴2014.11，12,2015年1,2月未发，建造师2014年8月至今未发。 我已经决定从仲裁申请，请问您觉得我这个主张会有什么问题，同时应该注意哪些，以及如何最大程度的保护好自己的权益。另签的合同是写的不定时工作制度,能否主张加班费，同时能否主张公司按实际工资补缴社保，及拖欠工资造成的经济损失。