谁是诉讼主体

企业于2000年改制，当时有202名股东在属地工商登记注册。2002年企业搬迁，2004年企业又进行了一次该制，又在所属地工商登记注册，这次登记股东113名，有接近100人没在登记中。同一份资产就有不同的股东。为什么会出现这样的结果，这是由一个人导演的，需另案起诉。现在的问题企业只有一份资产在不同的两个工商局登记注册都获得营业执照，谁做诉讼主体合适。
 如果起诉后者，后者会有各种理由，不会很快就得出结论。如果把两者都起诉，一审就会得出结论。因为矛盾的主体，只能选出一个。