求助经济案件专家

我有一家民营贸易企业。去年将部分业务分包给了一个朋友。也就是说，他个人利用我企业在当地的知名度和他自己的努力来为我公司拓展业务，盈利我收取部分管理费用和资金占用费后都归他。从采购到销售，从开票到款项结算，都由他来操控。最近，我企业内部审计时发现，他去年采购的一部分商品的进项发票疑似是他通过自己在其它省市拥有的公司所开具的发票。具调查该批发票疑似是他公司虚开的。请问此批业务对我公司有什么影响，我公司需要怎样操作。