承包合同是否有效 ，如何赔偿

问题:甲方有一个砖窑，没有合法手续，与乙方签订了一份承包合同，由乙方承包甲方的砖窑，乙方按年交给甲方承包费，甲方答应由其办理开砖窑的一切合法手续，合同约定：如甲方因办理不了合法手续而产生的损失有甲方承担，但乙方的一切建设投入必须有表册登记。后乙方交由甲方保证金五万元，后乙方便开始运营砖窑，在运营过程中甲方手续一直未办理下来，后砖窑被相关部门勒令停工，双方产生纠纷，请问这个承包合同是否有效，损失责任如何分配？法律依据在哪里？
合同是书面合同，形式有效，是否砖窑没有手续，就不能承包，是否为无效合同，乙方有些花费只有白条，没有正规收据而无法载入表册，打了白条的损失能得到赔偿么？