奶奶的房子，我出的钱，将来会有遗产纠纷吗？

我奶奶一直和我叔叔一起住，住了有十几年了，条件一直都不好，我叔叔的老婆对我奶奶也很不好，2010年，以我奶奶的名义和我叔叔家的实际情况申请了经济适用房，开始我叔叔的老婆说他们家没有钱，决定要放弃这个机会，我觉得放弃了可惜，于是就和他们商量，机会让给我家，奶奶从此就跟着我们生活！他们也同意了，并且我们协商好，我家给他们家一万块现金，从此这个房子就跟他们没有关系了，白纸黑字也都写好了！可是到了今年上半年，他老婆就反悔了，一直催着我们把房子还给他们，还说给我们3万块做补偿也可以！
我们很苦恼！现在我奶奶还健在我叔叔的老婆就这样！以后我奶奶百年了之后，她如果过来争房产怎么办？现在我们房产证还没有拿，所以我想请问，当我们去交钱办产证的时候我们可以做什么，来防止今后的一切纠纷！
这个房子完全是我们家自己拿钱出来买的，我奶奶一分钱都没有出！但是因为是以她的名义申请的经济适用房，所以房产证上只能写她一个人的名字！
谢谢~