二楼和三楼关于平台阳光房纠纷的法律问题

甲方二楼业主，2012年入住某小区二楼带大露台的房子。并于2012年搭建约12平方的阳光房。在甲方搭建之前，同一平台已有三户业主搭建面积相似的阳光房。  
乙方三楼业主，2014年入住。于2014年冬天提出要甲方出资安装不锈钢栅栏。甲方同意并及时安装。完工后甲乙双方签署了一份协议，内容为双方就阳光房产生的纠纷到此为止。
2015年甲方阳台顶面漏水，经物业维修人员检查系乙方空调外机下水槽漏水所致。物业及甲方多次与乙方沟通协商，乙方均韦允许从其室内进入阳台外机摆放处进行维修。不得已，物业只得从甲方阳光房顶上对其下水槽进行维修。维修期间物业人员和甲方均未进入乙方阳台及室内。未对乙方生活造成影响。
乙方因此次维修，再次向当地城管部门举报，要求甲方将阳光房拆除。如不拆除，要求甲方在阳光房顶加装防反光及隔音材料，并对乙方阳台加装铸铁雕花栅栏。而本地绝大部分商品房均安装不锈钢材质栅栏，两者价格相差近一倍。并要求在其卧室飘窗外围加装隐形防盗纱窗。乙方从与邻为善考虑，同意出资安装。但要求甲方在施工之前再签署一份有法律效力的协议。以此将由阳光房引起的纠纷彻底了结。
甲方明确拒绝。并扬言要乙方先安装，达到甲方要求，甲方才会考虑签协议。
此事历时两年多，期间派出所和城管部门多次协商。现甲方见乙方坚持先签协议再安装的态度坚决，扬言起诉。故此请教律师，甲方该如何应对？如乙方去当地法院起诉，具体流程是哪些？如法院立案，如何能有对甲方有利的判决？