发票纠纷

律师您好，我单位是建筑单位，一个包工头一直为我单位的工程提供劳务分包（但没有合同），但包工头一直未给我单位提供劳务发票，所以我单位在工程款中把发票款扣下了，只要包工头提供劳务发票，单位就支付该款项。现在该包工头将我单位起诉至法院，要求在不提供发票的情况下，支付给他剩余工程款，法院现在支持。但我如果支付了该工程款在财务上就是违规的。法院说包工头不提供发票属于刑事案件，我单位不付款属于民事案件，法院只针对原告方提出的民事案件判决。请您帮帮忙，看我单位应该怎么办。