如何讨回欠款

律师您好，我焦急万分期盼得到您的帮助！
我先说一下大体情况：2009年，我与合伙人共同出资接手了康师傅饮品濮阳城区总代理，当时是以合伙人的名义起的个体工商户的营业执照，与康师傅公司的合同也是合伙人的名义；公司账户也是合伙人的名字；去年合伙人撤资，（实质上一直是我在做着康师傅的经销商），账务清算过程中，（他不认亏损；赖账两万多；外加一张中间人为了让他出具证明时写的欠条）他出具了一份我和他之间合作解体，他已撤资，康师傅公司所欠账务全部在我名下的证明；但他始终不让公司给我过户。康师傅公司也以只认营业执照上的名字的名义，推托着不给我开户、不给欠款。
现在公司欠的几笔帐，只有合伙人出具的证明，我如果告公司的话，没有跟公司的合同，我该怎么才能要回公司的欠款？另外，我仓库还有康师傅的库存货物能证明我是实质经销商，如果不干，康师傅公司应该把货物盘走，他们拖着我该怎么办？
诚恳求律师给予指教，非常感激！