厦门户口的应届毕业生的档案和户口问题

我是2012的应届毕业生。厦门户口，在福州读大学，现已找到合适的工作单位并开始签订就也协议。公司是外企，中国总部在广州，毕业后开始的前几年是要在福州工作。公司可以帮忙落户广州。我想问这种情况下我的档案应该放在哪里？是在福州人才市场还是打回厦门原籍比较好？貌似档案是和户口一起走的？我听说打回原籍的话不太好。具体想再咨询一下。麻烦你抽空帮忙解答一下。谢谢。