关于房屋土地使用权侵权纠纷

我家在1996年公路修建时房屋拆迁，政府给予了一定的经济补偿和一块相应的地基作为重建住房，因当时建房钱不够，于是1998年和同村的一人（此人姓杨）在我家地基上合伙修建了一栋3楼的房屋，一楼是两个铺面，二三楼是住房，当时是这样协商的：地基转让与杨修房，我家出一万元，得2楼住房和一个铺面，杨得一个铺面和3楼住房。相关协议是我妈妈和杨签下的，土地使用证和房产证也是我妈妈的名字。事隔4年，2002年杨又要在3楼顶为他女儿盖了一层住房，我妈当时反对，当年我们全家去了浙江，2008年回家，结果他们已经盖了四楼，没和我妈签任何协议，请问他们是侵权违法修建吗？补充一点，就是我爸妈在2000年离婚，房产属我妈，杨声称他们盖建四楼是经过我爸许可的，并给了我爸3000元钱，请问律师我爸能支配我妈妈的土地使用权吗？我们现在能起诉他们吗？而现在政府对街道进行外貌整修，会在我家这栋楼的顶楼再免费扩建1.8米高，请问，像这种情况我家会有怎样的权益分配呢？