轻伤害的疑惑

大律师，您好！ 我有一个困扰几年的问题，在这里向您请教一下，希望您在百忙之中给我指点迷津。先表示感谢！ 
三年前，我叔叔的朋友因为一点小事与人发生了摩擦，双方都伸了手，我叔叔的朋友和对方扭打在一块（没有凶器），互有皮外伤，我叔叔当时是拉架。对方报警，事后，双方在当地司法部门鉴定是轻微伤，公安局对双方进行了治安处罚。警察对我叔叔的朋友处理比那方重，于情于理叔叔觉得不公平，叔叔就和警察理论，发生了争吵，后来警察把我叔叔也一起处理了。（说那方有证言，叔叔也参与了斗殴）拘留了几天，罚了钱。结束后一个月左右，对方又到上一级司法部门做成了轻伤。要求叔叔和朋友负刑事责任，并赔偿。 
经了解，卷宗中的证人证言都是他家的亲属。我们怀疑他做的法鉴有问题，要求他再次到省级司法鉴定重做，他不肯去。公安局把我叔叔和朋友分别都取保候审了，由于那方的诬告，现在叔叔的工作已经被单位停止了。现在取保候审都过去了，他家人出门了，过一段回来。警察说以后他家再追，他们还要找我叔叔和他朋友。还要再次处理。叔叔和他朋友因为这点事，这几年整的很惨了，本来就是冤枉的，还再变本加厉，真是让人气愤难挡。从做人来讲，我叔叔是好人；从法律讲，他根本就没打人。他家人很不讲理，天大的无赖。天地可见！ 
大律师，这件事情，从事情发展的逻辑（后做轻伤是脖子有骨折，说叔叔和他朋友两个人同时用胳膊背的，我想脖子那么细，两个人的脖子怎么能一起背上？），证据，法鉴等上存在很多漏洞，就因为他家人能告状，能歪曲事实，公安局就怕他们。再说，让他再次鉴定他不去，警察以证据不足对我们取保候审，现在取保结束很长时间了。怎么还要处理他俩，这事什么时候能结束啊？ 
大律师，给我出点主意吧。让身陷困境的一家人都能从新的笑起来，为我叔叔洗清冤屈！给我们一些力量吧！ 
您费心了，期待您的答复！我就20分，都送了。