考研要交违约金吗？

本人应届毕业生，在考研成绩出来之前一年与一家公司签订了三方就业协议（教育厅印发），公司没有与我们签正式劳动合同，就业协议有公司让我写的补充约定违约交2500的违约金，从未去过公司培训实习之类活动，今年得知考上考研生了，现在需要调档，学校需要三方就业协议才给调档，这就必须和公司毁约，公司方要求我支付2500元的违约金才给我就业协议，当时签协议时单位没有说明考研要交违约金。据我了解新劳动法说没有经过培训的可以不用交违约金。
补充：就业协议书上有特别注意事项第二条：毕业生因升学、入伍等无法履行本协议，应与用人单位事先约定。（当时未约定)
特此寻求律师帮助。