如此协议书具有法律效力吗

本人在广东农村，父亲于2000年要在自家自留地上建新房，但那块地刚好在另一家人的屋门前，距离其门坪6米左右，如建一层刚好与他家门坪齐平，如建两层则挡住其房屋视线。众所周知，农村人相信风水，所以对方死命不让建，扬言要告状。无奈之下父亲与对方签了一份协议书，承诺只建一层，不再建第二层。现在，本人对那份协议书持有疑问：1、怀疑那份合同是不公平的合同，不具有法律效力；2、如果有法律效力，我该怎么办。协议书的基本内容如下，附：协议书。
                   协议书（有关B建房一事）
甲方：A
乙方：B
有乙方堂侄B在甲方堂叔A屋门下建房一事协议书。为不妨碍甲方A原建房的房屋门面视线，经双方议定特订如下协议。
1、乙方B建房在原有基础上建房一层高度不得超过3米50公分。
2、乙方的第二层只能建一间楼梯间（面积不超过20平米，高度不超过2米），其余永不得再建造。
3、甲乙双方不得违反本协议。如有违反，另一方有权干涉，如造成经济或其他损失，责任自负。
4、本协议书自签订之日起生效。
5、本协议书一式三份，甲乙双方各一份，另国土所一份。
（另注：二楼栏杆不得超过三十公分）
甲方签名：A                     乙方签名：B
见证人签名：C（族长）、D（B的妹夫）、E（国土所所长）

                                   2000年某月某日