农村房产纠纷

我爸爸家有姊妹6个，五个弟兄一个妹妹，一个叔叔是送亲戚家养的。我爸排行老二。当年由于家里田地多，就把初中没毕业的我爸被拉回家做农活。没有分家前，家里的所有农活都是我爸爸妈妈在做，就连建的十间房子的房产证都是我爸爸的名字。建房子时由于资金不够，爷爷承诺妈妈拿出5000元就分给最边上的两小间。分家后，各自分有属于自己的房子，到如今已有15年左右。然而，现在奶奶说房子没有分过，我们家没有分给过房子，别的几个兄弟的是分给了的，就没分给过我们家任何东西。乡司法所的来调解，就凭奶奶手上的一张爸爸按了手印的协议判房子是奶奶的。（协议至如今妈妈都不知情，当时是大伯和小叔争什么事说是让爸爸按个手印作证的，就只有爸爸奶奶叔叔大伯几个人，憨厚老实的爸爸也没看看过协议写着什么就按了手印。）我们家不服这样的调解，但司法所的不听我爸爸妈妈说，他们说在农村不看房产证，只看协议.......
   我想知道，司法所有这个权利把我自家的房子强拿走？分房的协议有效吗？房产证就这样没有价值？我方该怎么做？难道老老实实苦了这么多年的成就就这样看着被恶人抢走？？？