房屋逾期交付，开发商以之前签订《房屋认购协议书》逾期交付首付的时间抵消交房时逾期交付房屋的时间

你好，我在2011年九月认购的房子，并签订了《房屋认购协议书》，交付了定金。但是房屋到今年2013年6月才交工验房的。我和开发商签订的《商品房买卖合同》上签订的房屋交付时间是2012年10月30日，按合同上计算大概违约逾期交付房子210天左右，折算违约金大概1万3千多元，但在最近和开发商商定违约金事宜的时候，开发商单方面给我和算违约金才3000多元，开发商给我的解释是我因在签订《房屋认购协议书》后，没有按时间交付首付金额，我在签订《房屋认购协议书》后5个月才交的首付办理的《商品房买卖合同》，他们以我延期交付首付为借口，拿这个逾期的时间抵消他们逾期交付我房子的时间，这样合法吗？开发商在和我签订的《房屋认购协议书》中并没有提到违约交付房屋首付需要交付违约金的款项。

我签订《房屋认购协议书》大概是在2011年的9月份，交付首付并办理《商品房买卖合同》是在2012年5月份，办理个人房贷是在2012年6月18日，贷款金额到账是在2012年7月份，8月份开始还贷款，《商品房买卖合同》约定房屋交付日期是2012年10月30日，实际交付日期是2013年6月份。
另外按《商品房买卖合同》违约时间计算开发商违约7个月左右，但他们说要扣除2个月的时间，说是，不可抗因素延期的时间，这个解释合理合法吗？