关于中标后拒绝签订合同的问题

我们单位向供应商发布标书时要求账期为90天，供应商缴纳了3万元投标保证金后，双方在标书中约定如供应商中标后拒不履行合同或不签订合同的，我公司有权扣除该保证金。供应商也在标书后签字盖章了。但该供应商中标后声称其不同意90天账期，拒签合同，且已“付款约定条款双方不能达成一致，所以不能签订合同”为由，要求我公司退还保证金。 

我认为，标书也属于协议，对方既然签章，表示同意标书中所示账期，所谓付款约定条款双方不能达成一致，其实是供应商违约行为。我公司有权根据标书扣除保证金。 

不知道我的想法对不对，另外我们给他们公司回的律师函应该怎么写，谢谢各位律师。