经济纠纷

我是陇县新海石料厂的承包人，我厂的销售员冯某去年因病去世。他的儿子趁厂里没人的时候窃取了厂里的公章（未备案），协议，账目。随后他向欠款方发了告知书，不让欠款方给我们付款，要求所欠款项打入他的账户。从去年年底到今年4月份我们去欠款方多次讨要，分文未付。无奈之下将欠款方起诉到甘肃省平凉市华亭县人民法院。由于公章被窃，起诉时使用的是石料厂被承包人（法人）的公章，当地法院以与实体不符，证人证言不一致，证据不足为由驳回请求。7月份又将欠款单位起诉到平凉市中级人民法院，开庭后法庭说事实都已查清，但不能把欠款直接判给我们，要走法律程序。
    请问贾律师走法律程序是什么意思？
    我们是陕西省人，感觉甘肃省平凉市华亭县人民法院是地方保护主义，再有理都说不清，有冤无处伸，有理无处辩。
    叩谢，等待律师团队及时回复!