农村自留地使用权转让纠纷

我朋友于2003年与人签定了土地使用权转让协议，协议内容如下：《长期转让土地协议》 甲方：×××   乙方：××× 1、甲方×××将大路边住房土地100平方米，每平方米一次性以50元计算，共计5000元，一次性长期转让给乙方×××使用。2、此协议从2003年9月18日起由乙方×××使用，甲方×××就与土地无任何牵挂。
2008年甲方以此协议为私自行为，不符合《宪法》《土地使用法》为名，将乙方告上法庭，要求判令此协议无效，乙方返还土地。法院未与支持。
2011年1月，甲方又将乙方告上法庭，称此土地为自留地，不能进行流转，故双方签订的转让协议无效。
  请问：农村自留地使用权可以进行流转吗？甲乙双方签订的此协议有效吗？