农村宅基地纠纷

我家南邻是村委会，因为原来是老房子，一直也没有垒南墙，现在翻盖新房后想把南墙垒起来，由于村委会房屋后面有后窗户，所以他们极力反对我家垒南墙，（注：没有紧挨着他们房后山墙垒，约20cm空隙），宅基地证是87年发的，当时村委会已经私自将我家宅基地证南北尺寸涂改（现将涂改痕迹去除后显示我家正确的宅基地尺寸），缩短一米多。所以现在他们咬定我家属于侵权建筑，但是在土地局备案中的宅基地尺寸与没有修改过的宅基地证尺寸和我家原有建筑实际丈量全部一致。现在村委会已将我家起诉到镇法院，他们说以宅基地证为主，以土地局备案为辅，对我家很不利！请问宅基地证与备案不符以哪个为主？宅基地证被村委会涂改后是否有效？我们该如何维护自己的正当权利？很着急！谢谢！