劳动合同和时间问题

本人是实习生，在签署劳动合同入职之后的六天后，发现劳动时间和环境与合同不符，主动提出离职，在和经理沟通后，征得同意不用上班，然后第二天提交书面离职申请书，请问在离职申请书同意之前，不去上班算旷工吗？我可以拿到这六天的工资吗？这对我以后找工作会有影响或者记录吗？，如果可以请问在申请书生效后我多少天内可以拿到工资？还是需要在公司规定发工资日才能拿到工资？申请书多长时间自动生效？在这六天中每天都按时上班，可是由于打卡机器问题，有两天打卡记录还有一次，这会作为扣工资的依据吗？因为是实习生，刚来上海，什么都不懂，请见谅，很着急，谢谢。