土地法律关系村里买房有效吗

我是湖南省某农业县某乡某村的主任，1995年8月因村小学破旧，我村购买了一个占地面积约4亩且废弃三年多的乡办企业做新学校，当时有分管副县长、分管副乡长、县农行行长、教育局长等许多领导到场参加协调，没人提出任何异议。
该乡办企业地处我村第三、第四组交界处，历史上曾是一座庙，1951年土改时乡农会曾陆续分给本组十几户村民居住，1960年建乡粮店占了部分土地，1968年修人民公社时将庙里最后几户村民迁走，1986年乡政府迁往别处，经县农业银行提供贷款，这里办成了一个乡企业，但企业没办起来就一直闲置着。
 学校开课后，原企业保管员宁某（我村第十组村民）却长期占居着4套房子，拒不搬出，1997年7月他声称所住房屋已通过乡企业办主任购买，但并未出示证据。2011年8月，宁某欲拆除旧房翻修，村里拦阻，他才拿出日期为1995年3月的协议书和收据。
我认为该企业土地现已经全部属于村集体所有了，宁某拿出的这些协议书和收据即使属实，其买卖乡企业房屋的行为也应是无效的，他无权在该土地上翻建新房。但国土局执法人员却不这么认为，请教大律师分析一下本案所包含的土地法律关系，好吗？