农村的农业用地被镇政府收回（给了少许补贴）后给开发商盖商业用楼，合法吗？开发商和镇政府把土地性质改变

1、我家在河边有实际自留地1.3亩，为什么土地证上只写了0.6亩？证上写的亩数比实际拥有的亩数少了一半多？从法律的角度我们怎么证实实际上我们确实拥有的亩数1.3亩？需要哪些证据？

2、前年2009年11月份政府以修路建堤为由征收回1亩（当时给了少许补贴，还和政府签了补贴协议，没有其它征收手续，土地证还在我家，面积还是原来写的0.6亩），今年才知道政府不是用于修路建堤，而是给开发商用来建设商业用楼（有农贸市场、商场超市、住宅），开发商要在农业用地上建设商业用楼，他们需要办理哪些手续？需要办理哪些证件？这算是合法的吗？我们和政府签的补贴协议有无法律效应？

3、我家的1.3亩自留地都在开发商的规划范围之内，被政府证了1亩，给了我们少许补贴，还留有0.3亩和政府签了一个协议，协议的主要意思是：开发商在0.3亩的土地上给我们盖三层楼，然后以建造价卖给我们，是为了以后我们有个生活保障。这个协议也是2009年签的，有政府的盖章和我老爸的签字，请问这个协议有法律效应吗？现在镇政府领导换了，新领导班子不想承认这个协议了，我们和政府协商多次都没能达成利益一致，现在我们应该如何维护权益？

4、现在开发商已经开始动工挖掘地基，我们和镇政府未能达成利益一致，我们是否有权利不让开发商动工？（不管是被征收的1亩土地还是签了特殊协议的0.3亩土地），我是担心到时开发商和政府勾结强行挖掘，阻拦行为过激，我父母又无能为力，闹出意想不到的不好结局。请专注土地法的好心律师帮我解析？非常感谢！