三方协议违约金

我今年四月份未毕业时与一家国企单位签订了高校毕业生就业协议，期间七月毕业，我在三月份就已经开始在该企业工作，一直到八月底辞职。问题是我当时辞职的时候公司批准了，现在我去转档案公司却以我违约为由让我交纳1000元的违约金才跟我网上解约，然后再给我转档案，否则就不给我转档案。我工作的五个月中，该企业也没和我签订劳动合同，当然也没给我交过保险。请问我通过当地的劳动仲裁是否能顺利地要回我的档案并且让该企业赔偿我2倍的工资？依据是劳动法的哪些条款？
协议上面只说：甲方和乙方有一方如需变更和终止协议，必须征得另一方的同意，否则要承担相应的责任。违约金1000元整。