劳动合同解除

我二月份打了辞职报告，未满30天，但经公司同意离开后，一直没回公司总部办理离职手续。公司在辞职信递交后30天后，也一直未办理办理减员，故此，公司在其后依然为我上交了3到8月份的社保。最近回到公司总部，办理相关手续。但公司要求我承担3到8月份已上交社保共计1万多元（个人部分和公司承担部分全部由我个人承担），要不然公司就不放我档案。请问，这是否合理？另外，在这种情况下，我的合同终止日期应该是辞职报告上交一个月后，还是到现在（11月份）？