房屋拆迁问题咨询（急）

我们是沙坪坝区的拆迁户。现在正在进行拆迁。我们家的大体情况如下：
86年，由于我母亲和舅舅均下岗，年龄也偏大，所以将我家的住房用于经营性用途。住房用作经营性用途是经过企业同意的，并且企业还扩建约22平米。利用住房45平米，共67平米。副食店，开业至今已20多年，期间均办齐合法有效的手续。另还向企业后勤处交纳门面管理费，现留有开据的发票（四年一缴）。
    02年企业由于经营不善破产。破产之前，我家要求办理非注册手续，房管局表示需要企业出具相关的材料和手续，但是至今企业不予办理。理由是我们属于划拨地，不能办理。后来也只给我们办理了住房的45个平米面积的住房性房管证。
    我们家经营性用房的依据：
    （1）工商营业执照   
    （2）税务登记执照（含税票）
    （3）烟草专卖许可证
    （4）酒类流通备案登记证
    （5）食品卫生许可证
    （6）企业与我们签定的门面协议
    （7）其他相关经营手续   
现目前拆迁大体面谈一次，觉得很不合理。主要有以下疑问：
1经过单位同意扩建的面积是不是按照违章建筑来进行赔付？    
2依据去年的一个关于房屋拆迁赔偿安置的个案的判决书，经营性住房，本区的政策一般是按照周边临街门面价格的50-80%来赔付，不是由拆迁主管部门说多少就是多少的。这么大的悬差应该有相关标准。
    3如果说房管证上是45个平方，（我们是三间屋子）实际均在经营，并未用做其他用途。但拆迁公司只拿其中的一间屋子的面积作为经营性住房来赔付，是否合法？