挂号信作为证据的问题。

我公司和某厂有经济往来，该厂还有部分货款未和我公司结清。
原来我公司和该厂联系的一个员工前段时间离职了，我公司怕该员工去那个厂里把剩余的货款私自结了，
就用挂号信发了份函给该厂的法人代表，意思就是剩余的货款只能由我公司的法人代表来处理，原来的那位员工无权处理该笔货款。
但是最近该厂竟然还是把款结给了我公司的原来的业务员，我和该厂交涉的时候，他们说没看到函件，但是邮局查询该挂号信是由该厂的门卫签收的。
请问：我公司发给该公司的那份函件可以作为证据么？
如果到时候打官司，那个厂里的人说挂号信是门卫签收的，厂里的法人代表没有看到，那该怎么办呢？
盼回答，谢谢！