土地登记纠纷 如何保障权益

文革上山下乡时我爸留在家里 ，我叔去了异地工作92年办理农村集体土地使用权证时 只写了我父亲的名字。 后我叔2000年退休回来要求产权共有 ，我父亲同意画押， 我叔带申请报告去房管局申请后没受理 ，土地使用权还是我父亲的名字！！！2000年后因为我达到婚龄 我父亲对房屋进行了一系列的翻修改造加盖 都是我们自己出资 ！
现因不动产登记92年办理农村集体土地使用权证时 只写了我父亲的名字 我们根据土地使用证办理登记， 后我叔提出异议带土地局办事人员来 要求共有 ，在咨询办事人员时， 其说只能共有不能分割 ，而且共有份额不详细记载， 因照顾高龄叔的身体 ，我当时没有多想就同意共有 ，后想想这样会造成以后共有份额纠纷 ，就找土地局办事人员提出异议， 办事人员说按有争议处理 材料作废 电脑记录删除 ！
现要求土地局办事人员来登记 ，其说要我们与我叔之间达成一致 没有争议了才能登记！！
想咨询下 要怎么处理保障自己权益