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第一条 为了加强医药专利的管理工作，促进医药专利技术的推广应用，保护发明创造的专利权，调处专利纠纷，更好地为医药科技进步服务，特制定本办法。
第二条 国家医药管理局科技教育司设立专利管理处负责全行业的专利管理工作。各省、自治区、直辖市、计划单列市医药管理局亦应设置专利管理机构，或由专人负责本地区的专利管理工作。
第三条 国家医药管理局负责提高和推动医药行业的专利知识宣传教育工作，提高本行业职工的专利意识，并负责向国务院有关部门反映本行业对专利的意见。
第四条 医药系统各企事业单位，在列科研计划、开展国外科技合作、参加展览会、组织产品出口之前，必须对项目的专利法律状况进行调研，以提高科研的创造性水平、避免侵权事件的发生。
关联法规：
第五条 凡国内合作研究或委托研究的科研项目，必须事先订立书面合同，对所创造的专利的权属问题作出明确规定，为申请专利避免纠纷打下基础。
第六条 医药系统的单位或个人，向外国申请专利前，首先向中国专利局申请专利，并报国家医药管理局审批同意后，委托国务院指定的涉外专利代理机构办理国外申请手续。
第七条 医药系统的单位或个人，在与国外进行科技合作中取得的成果，依合同规定单独或联合向国外申请专利时，须报国家医药管理局备案。
第八条 医药系统的职务发明申请专利时，必须经单位批准后向中国专利局申请，并将申请文件副本报国家医药管理局备案。
第九条 医药系统的单位或个人向外国人转让其专利申请权或专利权时，必须经上级主管部门同意后，报国家医药管理局批准，并由当事人双方订立书面合同，经中国专利局登记后生效。
第十条 国家医药管理局根据国家计划，有权决定本系统内的重要发明创造专利允许指定单位实施。对国家利益或者公共利益具有重大意义，需要推广应用的集体单位或个人的专利时，亦可由国家医药管理局报国务院批准后允许指定单位实施。实施单位应向专利权人支付使用费。
第十一条 专利权人自专利权授予满３年，无正当理由未能在中国实施其专利时，具备实施条件的单位，可以向中国专利局申请强制许可，国家医药管理局将根据需要，协助企业创造实施条件，做好强制许可的申请工作。
第十二条 对未经专利权人许可实施其专利的侵权行为，在专利权人或利害关系人提出请求时，国家医药管理局有权责令侵权人停止侵权行为并赔偿损失，如当事人不服，可向人民法院起诉，期满不起诉又不履行的，国家医药管理局可请求人民法院强制执行。
第十三条 对于在发明专利申请公布后，专利权授予前，单位或个人未支付使用费使用了该项发明，在专利权授予后，专利权人可以要求实施单位或个人支付适当使用费。如果双方达不成协议，申请人可以请求国家医药管理局干预或处理。
第十四条 国家医药管理局从事专利管理或代理的各级人员，在专利批准前皆有保密义务，如有泄露发明创造内容者，国家医药管理局将责成其主管机关酌情给予行政处分；情节严重者，提交法院追究其刑事责任。
第十五条 要求国家医药管理局办理的一切专利事项手续必须以书面形式进行，否则不予受理。
