除了在目标上的嬗变外，WTO下的报复机制相对于GATT下报复机制有了较大程度的完善，主要表现在：（1）DSU对报复权的先决条件、范围、授权以及行使的程序规则等作出了严格规定，相较于GATT第22条仅作原则性规定而言，有了较大的进步；（2）允许跨部门、跨协定进行交叉报复，以增强报复的效果，维护报复方的利益；（3）WTO争端解决机制采用的反向协商一致的表决方式，使授权报复几乎自动通过，增强了报复的强制性。（4）根据DSU的规定，从投诉方申请开始到DSB作出授权决定的期限，DSB根据请求应在合理期限到期后30天内作出决定，如果提交仲裁，则应在合理期限到期后60天内结束仲裁，使争端能够迅速得以解决，而减少DSB拖延作出决定的现象发生。（5）DSU在强化争端解决机制上，要求有关成员在实施报复之前，应按照第22条规定的程序，确定报复范围，并取得DSB的授权，不得采取单边行动，这在一定程度上减少或制约了个别发达国家通过单边报复所带来的不确定性，有利于保护发展中国家的利益。（6）DSU第24条规定的最不发达国家成员方的特殊程序，要求各成员方在涉及最不发达国家成员方的争端解决程序中，应对最不发达国家的特殊情况给予特殊考虑。若发现利益的丧失或损害是由于最不发达国家成员方所采取的措施导致的，则投诉方在根据这些程序请求补偿或谋求报复时，应保持适当节制。
二、WTO下报复机制存在的问题
但是任何事物都有两面性，在WTO下的报复机制取得较大进步的同时，亦有其不足之处。
（一）WTO下报复机制在功能价值上的弱点
《WTO协定》序言部分表明，WTO虽然作为规制政府间有关贸易行为的组织，其终极目标是促进作为国际贸易真正主体——个体利益发展。然而WTO报复措施的实施很大程度上忽视了对个人利益的保护，导致了公益和私益之间保护的失衡。对于广大实施报复国的消费者来说，一旦报复机制得以实施，其必须承受因为关税提高或其它措施的实施而导致的商品等的价格上涨带来的不利后果，甚至失去了选择消费国外相同产品的机会；而对于受损害产业的出口商而言，他们也并未从中得到任何补偿。此外，在实践中，报复国一般会选择那些基础比较薄弱或对于被报复国“杀伤性”较强的产业实施报复以达到促进执行或保护本国弱势产业的目标，因此受损害产业的生产商未必会从中得到利益，WTO报复机制并没有帮助那些遭受违法措施损害的私人，WTO完全忽视了申诉产业利益的保护。WTO下的报复机制非但没有保护受损害方的利益，其“交叉报复制度”还可能对被报复国的第三人利益造成损害。由于交叉报复的对象是同一协议的不同部门或不同协议的不同部门，那么这些部门中的企业将为非直接相关的第三方的违约行为承担责任，而它们却不能从政府那里得到任何补偿，这显然是不公平的。