各国自由贸易区的功能具有一定的共同性，但由于具体情况的不同，又具有各自的特点。根据1934年《美国对外贸易区法》，美国自由贸易区的功能主要为进出口贸易、转口贸易和仓储。1950年，国会修订了1934年的法案，容许在自由贸易区内进行加工制造活动。1980年4月12日，美国海关当局作了一个裁定，允许用美国的零部件和外国原材料装配成品，其增值部分免于征税，进一步鼓励在自由贸易区内进行加工制造业务。[45]之后，根据对外贸易新的发展，美国自由贸易区的功能又有所增加，目前，其主要功能有：进出口贸易、保税仓储和简单商业性加工、商品展销、混合加工和制造及转口贸易等。[46]

　　巴拿马科隆自由贸易区具有便利的区外优势，因此，其主体功能为转口贸易，而为主体功能配套的辅助功能有保税仓储、金融和服务功能等。

　　智利伊基克自由贸易区的主要功能为转口贸易、进出口贸易以及相配套的仓储、装配、组装、加工、制造业等，而在仓储区内可从事展示、批发和仓储作业；在商业区内可从事展示和零售业务。允许在自由贸易区内开展零售活动是该自由贸易区区别于其他自由贸易区的一大特色。[47]

　　加纳的自由区（Free Zone）内容许从事的经济活动范围很广，除了货物的储藏和制造以外，还容许提供服务。[48]

　　总之，自由贸易区的功能已经从最初的单纯贸易功能发展到贸易、加工及其他功能综合发展的程度。各个自由贸易区往往根据自身的具体情况而有所侧重。

　　3.管理体制

　　良好的管理体制是自由贸易区健康发展的前提条件。自由贸易区管理体制包括两方面的内容：在宏观层面，政府对自由贸易区如何管理；在微观层面，自由贸易区自身如何管理。

　　在宏观管理方面，自由贸易区数量众多的国家通常设有专门的宏观管理机构，负责对全国各地的自由贸易区进行设区审批、监督、检查和协调管理。各国法律规定的中央主管部门有所区别，有的国家专设一个中央管理机构，如美国的外贸区委员会就是联邦政府领导的直接管理全国所有外贸区的最高机构；韩国政府于1973年1月6日解散了马山自由出口区管理局和其他工业区管理局，设立了工业区管理局，在工商部领导下，负责管理全国所有自由出口区的全面开发工作。有的国家则是有原有的中央部门进行监管。[49]

　　在微观管理方面，国外的自由贸易区有三种管理模式：组织管理模式、行政管理模式和混合管理模式。在组织管理模式下，通常由一个自由贸易区内的非营利的、私人的、公营的或公私合营的公司负责基础设施的提供。它们也从事一些经济活动，提供必要的后勤方面的服务。在行政管理模式下，往往由地方行政当局代表相关机构管理自由贸易区内的经济、贸易和工业活动，或者由当地的港口和海关当局直接进行管理。混合管理模式是对组织管理模式和行政管理模式的综合，在这一模式下，一个最主要的管理特征是对自由贸易区内的工作人员进行区分，通常分为出资人、管理人、商业经营人和服务协调人等，这些人都要接受政府的监管；此外，地方政府往往把相关的组织和管理活动转包给一个私人公司。最近对混合管理模式的一种修正是，由一个半国营商业机构集中处理自由贸易区运转的所有事务。[50]

　　4.优惠制度

　　为了使自由贸易区吸引国内外投资者，促进自由贸易区的繁荣和发展，各国政府尤其是发展中国家的政府，在制定自由贸易区法律时，往往制定许多优惠制度。

　　关税豁免优惠。无论是发达国家还是发展中国家的自由贸易区，关税豁免是最普遍的和必要的优惠手段。在美国，利用对外贸易区在关税方面的优惠有：①关税延迟（Duty Deferral）。关税（包括联邦消费税）只有在货物从对外贸易区运入美国关税领土（或者NAFTA国家如加拿大、墨西哥等国）时，才予以缴纳。这样可以使得对外贸易区的使用人得到现金流通方面的好处。②关税排除（Duty Elimination or Duty Avoidance）。货物进口到对外贸易区，然后从对外贸易区出口，除NAFTA国家以外，将不缴纳关税（包括消费税）。货物进口到对外贸易区，或者在区内在区内毁坏，也不缴纳关税和消费税。③倒转关税的减轻（Inverted Tariff Relief）（前以述及）。[51]