中心是1995年12月12日经批准成立的事业编制机构。
随着市场经济的发展，商标注册和管理的任务越来越重。为了解决商标局编制不足，工作人员超负荷工作的矛盾，更好地保护，加强商标注册审查专业队伍建设，国家工商行政管理局成立了商标注册中心，同时，将通达商标服务中心改为商标注册中心的内设机构。
该中心为国家工商行政管理局直属的事业单位，依据《》从事商标注册及相关的服务工作，具有一定的行政职能。目前下设7个处：综合处、申请处、审查服务一处、审查服务二处、审查服务三处、国际注册服务处、档案处。