商业银行的管理制度，是指保证正常经营的制度。它包括经营与管理两个方面。商业银行的管理制度是一个内容丰富、关系复杂的系统。建立健全的商业银行管理制度，是我国金融改革和发展的重要内容，改革难度很大，任务还很艰巨，需要一定的时间，不能一蹴而就。目前，要把主要的注意力放在按社会主义市场经济的要求，建立商业银行内部经营管理制度上：把经营业绩与经济利益挂钩，逐步建立起以利润为中心的财务管理制度；实行以存贷增量比例为核心的限额控制下的资产负债比例管理，以存款增量制约贷款增量；建立信贷资金计划的良性运行机制；强化岗位间相互制约，完善风险补偿制度，建立起以提高信贷资产质量为目标的信贷管理制度；依据业务量、经营效益和发展潜力等因素调整营业网点，以提高服务质量和适应竞争的需要；实行各级机构的等级管理，扩大对中层干部实行聘任制，对一般干部实行聘用制，巩固和发展行员等级工资制度的改革，以激发广大干部职工的积极性。
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