各位律师你们好。 我在青岛某商场从事销售工作，服务的品牌公司在上海，当时签订的劳动合同也在上海（由上海的劳动代理机构代办）。半年前因故离职，半年后在与新单位签订劳动合同时被原 单位告知半年前离职时商品库存不对，需要我对丢失的商品进行赔偿，但又拿不出具体的证据。并扣留了我的档案。 咨询过劳动仲裁机构，得知只能进行民事诉讼，而且是异地诉讼。请问这种情况下我应该怎么办？ 在档案扣留期间的保险等损失该由谁来承担？如进行异地诉讼，过程中产生的差旅费，误工费及诉讼费用可否要求被告单位承担？ 如果起诉是否要将原单位及劳动代理机构一起起诉？ 盼复，万分感谢。
----------------------------------------问题补充：--------------------------------------------------
合同上盖的是代理机构的公章，我属于劳动派遣性质，这样也是起诉原单位而不是代理机构吗？