公司合并后房产证的换证问题

我公司（陕西桥上桥锅炉容器制造有限责任公司）于2010年10月以吸收合并的形式，将原陕西省桥上桥压力容器制造有限责任公司、陕西桥上桥热力工程有限公司吸收合并为一个公司。合并前，三个公司的生产、生活场所都在一个大院内，但各自办理有土地证和房产证。今年已经办理了土地证使用权人的过户手续。在办理房屋所有权人变更时，县房产局认为这样的变更等同于所有权的转移登记，应按转移登记处理，过户费每平米6元、测绘费每平米1.3元。三个公司合并后房屋总面积一万五仟多平米，若按此公司将花费拾多万元|的登记费用。对此项收费，我们有一些疑点，特向你们咨询。
一、是企业合并引起房屋所有权人变更（公司名称变了），而不是买卖行为或个人的其他行为造成的。
二、公司合并后原投资主体没有变化，原来三个公司的股东仍然是合并后公司的股东，且每个股东的股权比例没有发生任何改变。
我们咨询的目的是因公司合并而需要变更房屋所有权人时，这样收费是否合理，应该如何处理这件事。
请给我们以法律援助。

    陕西桥上桥锅炉容器制造有限责任公司
二0一二年八月十六日
公司地址：华县赤高路口  联系电话：15353953905   0913-4883048