履约保函早于合同约定履约期到期失效怎么办？

某工程经招标后确定中标单位A公司，其建设合同约定履约保证期为“合同生效之日至最终验收后30日内”，由于合同履约保函在签订合同后30日内提供，A公司提交的保函期限为签发之日起两年，未能完全满足合同约定。在实际施工中，由于工程拖期等原因，履约保函在工程未完时即已到期失效，后A公司以各种理由拖延拒绝履约保函续期。请问：
1、A公司签订合同时提交的履约保函与合同要求存在差异，当时是否应及时签订相关补充条款，如未签订，是否会导致响应性方面的瑕疵，致使对其他投标单位的不公平？有没有违反哪些法规？
2、由于业主未及时与A公司就履约保函续期追加约定，在A公司履约保函到期失效时缺乏制裁手段，在这种情况下该怎样维护业主利益。